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复旦大学遗传学研究所金力、卢大儒等科研人员经过3年时间，在世界上首次系统地利用Y染色体上的单核苷酸多态位点(SNP)为遗传标记，调查东亚人群Y染色体单倍型的类型及频率分布规律，探讨东亚人群的起源、迁徙及其相互之间的遗传关系，取得重大突破。
关于现代人的起源，主要有两种假说。“多区起源”假说认为，自100至200万年直立人从非洲扩展到世界其它大陆以后，在各自的地区独立演化为现代的非洲人、亚洲人和欧洲人。相反，“非洲起源”假说则认为各大洲的现代人均来源于非洲。遗传学的证据倾向于支持非洲起源假说，而一些古人类学的证据则支持多区起源假说。
科研人员对12217个东亚人群中，检测了3个来源于非洲人的遗传标志。通过Y染色体上的单核苷酸多态位点(SNP)分析，发现这些东亚人群中无一例外地带有非洲人的遗传基因和标志，从而为东亚人群的“非洲起源”学说提供了强有力的遗传学证据。研究表明，约80%的东亚男性共享一组东亚人特有的单倍型，提示他们在遗传上有共同起源。北方人群的Y染色体类型相对单一，是南方群体的一个亚群。据此，推断史前东亚人群最早的迁徙路线是从南到北。
通过对汉藏语系代表民族的Y-SNP分析，发现该语系的各民族具有共同的起源，其祖先可能是远在3万年前由南方迁移并定居在黄河中上游地区的氐羌氏族，约6000年前，氐羌氏族的一支通过藏彝走廊向西、南迁徙进入喜玛拉雅地区，并由此产生了汉藏语系内的汉语语族和藏缅语族的分化。藏族而后同来自中亚的古老人群融合，形成在Y染色体包含东亚和中亚两个人群特点的多起源组合。在对包括台湾土著、东南亚各族及太平洋岛屿各族的研究中，否定了以前广为接受的玻利尼西亚人台湾起源说，提出包括中国南部地区在内的东南亚地区可能是在3000年前大批移民太平洋岛屿的玻利尼西亚人的起源地。
该项目的研究成果不仅为现代人的起源和进化研究提供了重要的科学依据，并为进一步以疾病及药物开发为目的的基因组多样性研究奠定了基础。卢大儒教授告诉记者说，最近，他们联合国内一些人类学、考古学、民族学、历史学、语言学界的著名学者，成立了目前世界上参与学科最完整的现代人类学研究中心。他说：“通过科研人员的共同努力，相信中国这一领域的研究将始终保持世界领先地位。”
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